Le noyau comporte les fichiers les moins "volatiles", dont la modification signifie une modification du coeur du modèle lui-même. Ces fichiers comportent la représentation du modèle considérée comme invariante par rapport à la typologie (régions, groupes, sous-groupes) et au pays lui- même. Il s'agit essentiellement du programme de génération de programmes et de matrices (le logiciel utilisé est MGG) intégralement transcrit sur le fichier 'aro.mgg'. Il s'agit aussi du programme d'interprétation des paramètres, qui fait le lien entre les paramètres et le GMP, et qui est transcrit sous la forme du programme FORTRAN 'intern.f'. Il s'agit enfin des paramètres externes (au sens de MGG, voir §2.2.2.1), qui définissent les indexations, et transcrits sur le fichier générique 'aroN.dat'.
On notera cependant que le noyau est différent selon qu'il s'agit du calibrage ou de l'exploitation du modèle (on ne modifiera pas le calibrage si le noyau est modifié pour intégrer telle ou telle modification de l'instrumentation de la PAC).