Un système de codage d'erreurs devrait être proposé prochainement, afin d'aider utilisateurs et concepteurs du shell AROPAj dans la détection des erreurs. De manière générale, il s'agit de repérer le groupement de commandes (i.e. les éléments du shell dont le nom possède l'extension '.csh') et la ligne de commande source de l'erreur rencontrée.
Certaines erreurs peuvent provenir de la conjonction de paramètres et d'appel de commandes dont la compatibilité n'a pas été suffisamment vérifiée. Elles relèvent de la responsabilité de l'administrateur du projet. Les utilisateurs sont conviés à prévenir celui-ci des erreurs rencontrées (le "cahier du jour" a été conçu en partie à cet effet, voir §9.2.2).
Il est également possible que certains menus n'offrent pas les possibilités affichées compatibles avec les contraintes soumises par l'utilisateur. Les précautions d'emploi sont normalement affichées dans les menus. En cas de défaillance, les préventions précédentes doivent être respectées.
Dans tous les cas, il convient de s'assurer de l'état des informations éventuellement disponibles sur les fichiers de suivi de commande et de calcul (i.e. les fichiers de type 'sortie.sortie').